Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifnb1P01575 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms