Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccl20O89093 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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