Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CopeO89079 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CopeO89079 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CopeO89079 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CopeO89079 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CopeO89079 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CopeO89079 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CopeO89079 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CopeO89079 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CopeO89079 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CopeO89079 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CopeO89079 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CopeO89079 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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