Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnmt3aO88508 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnmt3aO88508 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms