Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stra6O70491 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Stra6O70491 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Stra6O70491 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Stra6O70491 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stra6O70491 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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