Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BckdkO55028 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BckdkO55028 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BckdkO55028 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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BckdkO55028 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BckdkO55028 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BckdkO55028 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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BckdkO55028 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdkO55028 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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