Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trappc3O55013 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc3O55013 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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