Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbieO54910 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms