Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zmat3O54836 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms