Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChkaO54804 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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