Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms