Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bnc1O35914 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Bnc1O35914 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Bnc1O35914 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Bnc1O35914 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Bnc1O35914 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Bnc1O35914 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Bnc1O35914 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bnc1O35914 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Bnc1O35914 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Bnc1O35914 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Bnc1O35914 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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