Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pik3cdO35904 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms