Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Sp100O35892 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sp100O35892 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sp100O35892 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sp100O35892 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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