Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cops5O35864 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cops5O35864 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms