Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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TnxbO35452 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TnxbO35452 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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