Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Slc18a3O35304 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Slc18a3O35304 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Slc18a3O35304 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms