Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1aO35134 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms