Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ArxO35085 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ArxO35085 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ArxO35085 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ArxO35085 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ArxO35085 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ArxO35085 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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