Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-M9O19442 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M9O19442 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M9O19442 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-M9O19442 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M9O19442 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M9O19442 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M9O19442 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M9O19442 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M9O19442 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-M9O19442 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M9O19442 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-M9O19442 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M9O19442 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M9O19442 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-M9O19442 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-M9O19442 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-M9O19442 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H2-M9O19442 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H2-M9O19442 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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H2-M9O19442 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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H2-M9O19442 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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H2-M9O19442 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M9O19442 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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H2-M9O19442 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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