Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snap23O09044 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snap23O09044 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap23O09044 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms