Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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