Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eftud2O08810 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms