Protein–RNA interactions for Protein: O08791

Ebf3, Transcription factor COE3, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf3O08791 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ebf3O08791 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ebf3O08791 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ebf3O08791 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ebf3O08791 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ebf3O08791 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ebf3O08791 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ebf3O08791 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ebf3O08791 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ebf3O08791 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ebf3O08791 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ebf3O08791 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms