Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3aO08665 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sema3aO08665 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms