Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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MttpO08601 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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MttpO08601 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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MttpO08601 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MttpO08601 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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MttpO08601 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MttpO08601 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MttpO08601 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MttpO08601 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MttpO08601 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MttpO08601 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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MttpO08601 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MttpO08601 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MttpO08601 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MttpO08601 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MttpO08601 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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MttpO08601 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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MttpO08601 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MttpO08601 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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MttpO08601 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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MttpO08601 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MttpO08601 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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