Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MsmbO08540 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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