Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp35M0QWN7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms