Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20939L7N243 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20939L7N243 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms