Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm2035J3QP87 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm2035J3QP87 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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