Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms