Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm21972J3QN38 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm21972J3QN38 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm21972J3QN38 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm21972J3QN38 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm21972J3QN38 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Gm21972J3QN38 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm21972J3QN38 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm21972J3QN38 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm21972J3QN38 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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