Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm3415J3QMS8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm3415J3QMS8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm3415J3QMS8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3415J3QMS8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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