Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gm6176J3QK59 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms