Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm21818J3KMS6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm21818J3KMS6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms