Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21411J3KMS0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21411J3KMS0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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