Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm17535J3KMR8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm17535J3KMR8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm17535J3KMR8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm17535J3KMR8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm17535J3KMR8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm17535J3KMR8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm17535J3KMR8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17535J3KMR8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms