Protein–RNA interactions for Protein: G5E897

Kdelc2, KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelc2G5E897 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdelc2G5E897 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdelc2G5E897 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms