Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Vmn1r34G3XA52 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Vmn1r34G3XA52 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Vmn1r34G3XA52 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r34G3XA52 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r34G3XA52 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r34G3XA52 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r34G3XA52 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r34G3XA52 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r34G3XA52 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r34G3XA52 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r34G3XA52 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vmn1r34G3XA52 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms