Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna9G3X8Z7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna9G3X8Z7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms