Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Farp1F8VPU2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms