Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3371F7CQW8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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