Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms