Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atf6F6VAN0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atf6F6VAN0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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