Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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