Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syngap1F6SEU4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syngap1F6SEU4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms