Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmod3E9QA62 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms