Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8M1

Zfp358, Zinc finger protein 358, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp358E9Q8M1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp358E9Q8M1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms