Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzd2E9Q1M1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms