Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms